More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1707 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  87.39 
 
 
502 aa  854  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0372006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1707  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
469 aa  954  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3303  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  68.55 
 
 
462 aa  673  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00106265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1509  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  97.23 
 
 
469 aa  931  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2476  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  80.94 
 
 
474 aa  793  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  63.1 
 
 
501 aa  618  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3883  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  51.94 
 
 
470 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3223  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50.54 
 
 
463 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  52.05 
 
 
472 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50.76 
 
 
471 aa  465  1e-130  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2047  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  50.22 
 
 
467 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.154966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2448  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50.54 
 
 
471 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0212  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  49.24 
 
 
476 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  49.89 
 
 
468 aa  446  1e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50.33 
 
 
467 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5306  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  48.92 
 
 
477 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.59 
 
 
466 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  45.26 
 
 
481 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03582  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.82 
 
 
473 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4457  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
470 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63377e-07 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4367  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
470 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.04 
 
 
468 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4336  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
470 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4454  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
470 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116536 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4531  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
470 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  hitchhiker  5.33814e-06 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4054  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0478182 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4196  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0188  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.22 
 
 
468 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4408  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0258323  normal  0.0356369 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4024  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.09 
 
 
466 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4502  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0108138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5422  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.349391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4024  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
466 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.257057  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03847  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
466 aa  363  5e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0805855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0194  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.22 
 
 
468 aa  363  5e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03796  hypothetical protein  40.09 
 
 
466 aa  363  5e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0623556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1901  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.09 
 
 
477 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.961651  decreased coverage  0.000428846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.52 
 
 
476 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0589234  normal  0.30721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  40.73 
 
 
476 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4078  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
466 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4774  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.52 
 
 
465 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125317  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0137  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
466 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.647839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3787  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.04 
 
 
468 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
466 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483779  normal  0.676164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1719  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.56 
 
 
464 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0974339  normal  0.028819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2106  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.66 
 
 
464 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25390  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.3 
 
 
464 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2169  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.3 
 
 
464 aa  358  1e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14670  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.6 
 
 
464 aa  357  2e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3894  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.42 
 
 
476 aa  357  2e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1668  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.3 
 
 
464 aa  358  2e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1333  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.6 
 
 
547 aa  357  3e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201704  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1036  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.6 
 
 
547 aa  357  3e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3972  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.42 
 
 
476 aa  357  3e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3862  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
464 aa  357  3e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
464 aa  355  7e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2151  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
464 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148708  decreased coverage  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3591  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.87 
 
 
464 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.55 
 
 
476 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0951  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.91 
 
 
546 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.60958e-06  hitchhiker  0.00448412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2370  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.36 
 
 
466 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.13082e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.17 
 
 
464 aa  353  3e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2890  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.36 
 
 
471 aa  352  6e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5091  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.47 
 
 
466 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002152  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.51 
 
 
466 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0102006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0914  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.58 
 
 
470 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75336  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00265  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.09 
 
 
476 aa  339  6e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.14 
 
 
463 aa  336  6e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1805  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.2 
 
 
466 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1923  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  37.18 
 
 
463 aa  329  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2516  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.07 
 
 
465 aa  305  1e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 
466 aa  246  7e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  32.55 
 
 
500 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  30.57 
 
 
468 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.61 
 
 
589 aa  222  1e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 
467 aa  221  2e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
465 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 
472 aa  220  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 
594 aa  219  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 
467 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
468 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 
468 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.21 
 
 
467 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 
475 aa  217  3e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 
462 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.05 
 
 
467 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
467 aa  217  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 
471 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 
467 aa  216  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 
467 aa  216  1e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
467 aa  215  2e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.41 
 
 
467 aa  214  2e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
468 aa  215  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 
468 aa  214  3e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.18 
 
 
463 aa  214  3e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
483 aa  213  4e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
470 aa  213  6e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 
480 aa  213  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 
463 aa  213  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>