More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1691 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  90.45 
 
 		 530 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  100 
 
 		 534 aa  1063    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  50.18 
 
 		 538 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  48.24 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  47 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  47 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  47.92 
 
 		 438 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  45.19 
 
 		 412 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  38.08 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  36.07 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  44.4 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  33.33 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  43.15 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  40 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  60.16 
 
 		 478 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  62.5 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  41.91 
 
 		 449 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  35.06 
 
 		 328 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  35.27 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  38.8 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  48.36 
 
 		 465 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.28 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  50.83 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50.83 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50.83 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.65 
 
 		 323 aa  137  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  50.83 
 
 		 501 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  50.83 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  50.83 
 
 		 494 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  33.21 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.08 
 
 		 293 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.15 
 
 		 430 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  31.7 
 
 		 374 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  33.33 
 
 		 251 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  33.33 
 
 		 251 aa  127  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  35.2 
 
 		 298 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  33.33 
 
 		 251 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  30.27 
 
 		 262 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  32.17 
 
 		 250 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32.06 
 
 		 377 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  32.98 
 
 		 633 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  32.18 
 
 		 297 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  33.59 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  33.59 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  33.59 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  33.59 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  34.88 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  34.88 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  30.86 
 
 		 327 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  30.86 
 
 		 327 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  34.88 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  34.88 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  34.88 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  34.88 
 
 		 363 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  31.4 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  29.89 
 
 		 262 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  32.8 
 
 		 285 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  32.6 
 
 		 344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  33.33 
 
 		 251 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.4 
 
 		 274 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  33.33 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  33.33 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  32.2 
 
 		 250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  30.71 
 
 		 285 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  32.44 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  32.44 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  32.44 
 
 		 363 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  31.06 
 
 		 307 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  31.01 
 
 		 250 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  31.01 
 
 		 250 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  31.01 
 
 		 250 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  32.33 
 
 		 307 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  32.42 
 
 		 317 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  32.62 
 
 		 249 aa  117  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  31.82 
 
 		 285 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  32.56 
 
 		 291 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  31.94 
 
 		 328 aa  116  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  32.82 
 
 		 298 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  28.67 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  31.25 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  31.62 
 
 		 284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  30.52 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  33.33 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  30.93 
 
 		 250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  34.21 
 
 		 294 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  29.28 
 
 		 452 aa  114  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  31.13 
 
 		 298 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  31.13 
 
 		 298 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.02 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  32.08 
 
 		 309 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  32.05 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  32.05 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  32.05 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  30.8 
 
 		 289 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  32.54 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  31.02 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  32.05 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  29.55 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>