296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1568 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
662 aa  1345    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  44.67 
 
 
632 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  44.54 
 
 
318 aa  252  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  42.69 
 
 
359 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  38.99 
 
 
418 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.02 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.21 
 
 
423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
395 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 
402 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
328 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
335 aa  133  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.59 
 
 
405 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
415 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.09 
 
 
357 aa  128  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.25 
 
 
313 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.78 
 
 
362 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
421 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
438 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 
360 aa  124  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  32.39 
 
 
429 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.25 
 
 
313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.64 
 
 
373 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
418 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
418 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
334 aa  120  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
337 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
409 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
399 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.57 
 
 
431 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
342 aa  117  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
393 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  35.38 
 
 
456 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  35.38 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.57 
 
 
406 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
400 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
465 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.39 
 
 
350 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
416 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 
468 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
313 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.5 
 
 
387 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
313 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 
434 aa  107  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
323 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 
370 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
417 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.92 
 
 
381 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.88 
 
 
345 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
419 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.02 
 
 
328 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  24.93 
 
 
468 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
308 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 
342 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.03 
 
 
415 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
368 aa  101  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  34.29 
 
 
443 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  34.41 
 
 
460 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  34.41 
 
 
460 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  36.93 
 
 
374 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
325 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
390 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34 
 
 
451 aa  99.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
329 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
454 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 
385 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
356 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
313 aa  99  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  30.14 
 
 
437 aa  98.2  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 
414 aa  98.2  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 
320 aa  97.8  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
371 aa  97.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  36.52 
 
 
377 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
362 aa  97.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.58 
 
 
312 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
318 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
438 aa  95.9  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  36.02 
 
 
446 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  27.48 
 
 
352 aa  94.7  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
338 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  37.5 
 
 
395 aa  95.1  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  26.19 
 
 
657 aa  94  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.59 
 
 
348 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 
399 aa  93.6  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
379 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 
416 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 
324 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.26 
 
 
727 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.08 
 
 
319 aa  91.7  4e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  28.03 
 
 
323 aa  91.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.43 
 
 
405 aa  91.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 
671 aa  91.3  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
317 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  25.77 
 
 
440 aa  90.9  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  35.47 
 
 
431 aa  90.5  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.81 
 
 
352 aa  90.5  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  36.93 
 
 
438 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>