98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1462 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 126 aa  244  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  86.4 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  57.26 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  60.53 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  60.17 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  54.46 
 
 		 386 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  60.71 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  47.2 
 
 		 386 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  55.67 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  55.86 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  45.67 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  48.31 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  45.3 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  43.7 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  48.18 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  48.67 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  52.75 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  47.42 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  45.13 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  51.58 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  50.54 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  47.54 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  52.54 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  60.87 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  58.24 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  41.12 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  69.57 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  40.34 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  46.6 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  60.24 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  44.57 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  64.38 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  44.05 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  45.88 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  36.67 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  36.67 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  45 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  39.51 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  43.1 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  36.14 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  38.27 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  39.76 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  38.55 
 
 		 323 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  35.23 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  40.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  39.39 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  52.17 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  43.33 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  30.85 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  32.22 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  30.84 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  35.8 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  42.37 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  30.21 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  31.58 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  31.58 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  40.62 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  41.18 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  41.54 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  33.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  49.02 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  45.65 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  26.44 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  34.85 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  29.21 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  46.51 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  40.3 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  64.29 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  36.36 
 
 		 167 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  43.48 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  32.39 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  45 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  40.48 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0560  hypothetical protein  35.94 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.8331000000000001e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  36.73 
 
 		 124 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>