More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1434 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
92 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  95.65 
 
 
92 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  93.48 
 
 
92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  92.39 
 
 
92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  92.39 
 
 
92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  89.13 
 
 
92 aa  177  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  88.04 
 
 
92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 
92 aa  170  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 
92 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 
92 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  168  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 
92 aa  167  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 
92 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 
92 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 
92 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 
92 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  80.43 
 
 
92 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  159  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 
92 aa  158  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 
92 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 
92 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 
92 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  80.22 
 
 
92 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  80.22 
 
 
92 aa  156  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  80.22 
 
 
92 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  79.35 
 
 
92 aa  156  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
92 aa  155  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
92 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
92 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  151  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
91 aa  144  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  70.65 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  72.04 
 
 
91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
90 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  67.39 
 
 
93 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  69.32 
 
 
87 aa  127  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
94 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
90 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  63.33 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 
92 aa  124  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
92 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  67.44 
 
 
93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  67.44 
 
 
93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  123  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 
92 aa  123  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  61.54 
 
 
93 aa  123  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>