176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1402 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  78.4 
 
 
213 aa  310  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  75.59 
 
 
213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  76.12 
 
 
201 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  60.1 
 
 
224 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  60.1 
 
 
224 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  60.1 
 
 
224 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.55 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  58.82 
 
 
220 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.15 
 
 
212 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  54.85 
 
 
216 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  55.19 
 
 
213 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  54.85 
 
 
213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  51.17 
 
 
612 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  52.8 
 
 
589 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  51.39 
 
 
217 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  50 
 
 
598 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  54.11 
 
 
588 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  54.21 
 
 
554 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.21 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  54.21 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  53.74 
 
 
219 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  53.74 
 
 
219 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  53.74 
 
 
219 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.32 
 
 
213 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.66 
 
 
215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.68 
 
 
209 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.4 
 
 
210 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.47 
 
 
212 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  39.39 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.53 
 
 
206 aa  132  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.22 
 
 
210 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.9 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  36.68 
 
 
216 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  41.58 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.75 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  37.5 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.36 
 
 
210 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.5 
 
 
204 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.53 
 
 
210 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  44.26 
 
 
271 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.11 
 
 
211 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.53 
 
 
210 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.32 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  36.81 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.76 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.23 
 
 
199 aa  118  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.42 
 
 
214 aa  117  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  37.36 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.36 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2826  hypothetical protein  59.79 
 
 
99 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000275163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.36 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  37.36 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.36 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.36 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  36.32 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  36.32 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.27 
 
 
208 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.71 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  33.82 
 
 
582 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  33.82 
 
 
583 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.43 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.98 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.53 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  36.92 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.64 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  33.82 
 
 
583 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.7 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.36 
 
 
215 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  34.54 
 
 
210 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.89 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.84 
 
 
583 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.68 
 
 
210 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.63 
 
 
218 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  32.84 
 
 
583 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.3 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.34 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.13 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.49 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.1 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.99 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  36.11 
 
 
212 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.83 
 
 
220 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  36.07 
 
 
212 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.01 
 
 
210 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.85 
 
 
218 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.63 
 
 
216 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  34.9 
 
 
191 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.69 
 
 
204 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  35.38 
 
 
192 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  35.58 
 
 
544 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.25 
 
 
215 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  38.59 
 
 
208 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>