More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1320 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 395 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  81.19 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  67.73 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  64.97 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.14 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.63 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.7 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.7 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.23 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  56.6 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2449  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  57.65 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  48.85 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.3 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  65.93 
 
 		 244 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.12 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.93 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  33.84 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  33.63 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.82 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.06 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.23 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  33.13 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  31.61 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  34.15 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.53 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.83 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  35.36 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.36 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.02 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.86 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.78 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.7 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  32.7 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.78 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.8 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.19 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 405 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.59 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.65 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.13 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.7 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.92 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.17 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.92 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.5 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.73 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.42 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.2 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.8 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.73 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.22 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.03 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.03 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.64 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.83 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.26 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 		 393 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  29.12 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.63 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.51 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  33.24 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  28.82 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.48 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.12 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.07 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.85 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.44 
 
 		 394 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.16 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  29.1 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  32.11 
 
 		 433 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.61 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.29 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.49 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.92 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.77 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.04 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.37 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  28.84 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.25 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.63 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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