More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1287 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  100 
 
 
112 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  97.3 
 
 
112 aa  220  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  91.89 
 
 
112 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  90.99 
 
 
112 aa  203  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  83.33 
 
 
111 aa  180  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  82.69 
 
 
107 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  82.69 
 
 
128 aa  177  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  82.69 
 
 
107 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  68.63 
 
 
103 aa  144  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  69.7 
 
 
108 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  72.34 
 
 
105 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  70.21 
 
 
105 aa  139  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  72.34 
 
 
104 aa  140  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  68.09 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  68.69 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  68.69 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  69.15 
 
 
106 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  64.89 
 
 
100 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  64.89 
 
 
100 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  64.89 
 
 
100 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  64.89 
 
 
100 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  69.89 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  59.22 
 
 
105 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  68.82 
 
 
106 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  68.82 
 
 
108 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  68.09 
 
 
118 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  64.89 
 
 
100 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  67.74 
 
 
110 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  67.74 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  67.74 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  66.3 
 
 
105 aa  126  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  67.39 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  62.22 
 
 
98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  62.77 
 
 
105 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  60.64 
 
 
101 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  57.45 
 
 
100 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  62.64 
 
 
125 aa  120  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  54.26 
 
 
97 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  58.51 
 
 
100 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  54.74 
 
 
104 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  57.78 
 
 
101 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  56.67 
 
 
103 aa  105  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 
99 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  55.56 
 
 
101 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1409  integration host factor subunit alpha  53.76 
 
 
103 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0010312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  55.56 
 
 
98 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1472  integration host factor subunit alpha  53.76 
 
 
103 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 
113 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 
113 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 
113 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  48.96 
 
 
100 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 
101 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 
105 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 
99 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1739  histone family protein DNA-binding protein  54.64 
 
 
122 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.269584  decreased coverage  0.000883525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  54.44 
 
 
136 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 
100 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.998853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  55.81 
 
 
99 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  52.22 
 
 
96 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02112  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 
98 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  48.94 
 
 
99 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
99 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
99 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
98 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
99 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003703  integration host factor alpha subunit  52.22 
 
 
98 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  48.45 
 
 
101 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1810  integration host factor subunit alpha  47.42 
 
 
98 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2167  integration host factor subunit alpha  47.42 
 
 
98 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0460926  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 
138 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 
99 aa  100  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 
98 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 
104 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 
138 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 
138 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 
98 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2417  integration host factor subunit alpha  46.88 
 
 
98 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508912  hitchhiker  0.0000292071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  49.46 
 
 
98 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1902  integration host factor subunit alpha  46.88 
 
 
98 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1875  integration host factor subunit alpha  46.88 
 
 
98 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1830  integration host factor subunit alpha  46.88 
 
 
98 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1909  integration host factor subunit alpha  46.88 
 
 
98 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000003309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>