More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1251 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  70.19 
 
 
623 aa  909    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 
604 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  86.02 
 
 
601 aa  1094    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 
604 aa  731    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  83.36 
 
 
595 aa  1058    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
625 aa  748    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
623 aa  714    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
596 aa  1232    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
590 aa  651    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 
590 aa  911    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
591 aa  811    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
595 aa  732    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
591 aa  811    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 
593 aa  742    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
604 aa  729    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  88.42 
 
 
595 aa  1109    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
606 aa  708    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  72.79 
 
 
590 aa  907    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 
593 aa  857    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
590 aa  641    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 
591 aa  783    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 
591 aa  902    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 
590 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
591 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 
607 aa  846    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  72.79 
 
 
590 aa  903    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
599 aa  715    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 
590 aa  910    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 
594 aa  803    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 
619 aa  742    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  79.86 
 
 
594 aa  1007    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 
590 aa  795    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  62.85 
 
 
605 aa  802    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  72.77 
 
 
596 aa  946    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 
604 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  73.06 
 
 
590 aa  916    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 
609 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 
614 aa  730    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  83.7 
 
 
595 aa  1061    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  96.98 
 
 
596 aa  1203    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
591 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  83.36 
 
 
595 aa  1058    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
597 aa  792    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
600 aa  627  1e-178  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
608 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
604 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
605 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
601 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
606 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
588 aa  571  1e-161  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
581 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
603 aa  502  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
597 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
600 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
589 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
594 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
591 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
591 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
588 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
627 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  485  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
591 aa  485  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
595 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
589 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
614 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
619 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
590 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
593 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
598 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
592 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
594 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
598 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
590 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
591 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
594 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
594 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
594 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
599 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
610 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
608 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
597 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
600 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
601 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
592 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
595 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
593 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
614 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>