More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1218 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  91.31 
 
 
680 aa  1264    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
680 aa  1392    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  38.91 
 
 
685 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  36.23 
 
 
711 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.02 
 
 
689 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  36.49 
 
 
684 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  35.29 
 
 
695 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  35.23 
 
 
673 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.02 
 
 
691 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  34.02 
 
 
681 aa  364  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.61 
 
 
696 aa  360  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.54 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
681 aa  356  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  35.5 
 
 
663 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  35.5 
 
 
663 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  35.5 
 
 
663 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  34.13 
 
 
697 aa  354  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.06 
 
 
691 aa  351  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  34.52 
 
 
676 aa  349  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  33.53 
 
 
734 aa  347  6e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  32.99 
 
 
696 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
676 aa  343  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  34.46 
 
 
711 aa  343  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  34.54 
 
 
699 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  30.87 
 
 
695 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  33.06 
 
 
741 aa  329  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
710 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  34.15 
 
 
702 aa  328  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  33.48 
 
 
722 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  33.24 
 
 
697 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.93 
 
 
697 aa  326  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  33.97 
 
 
688 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.37 
 
 
704 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  31.84 
 
 
697 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  32.13 
 
 
696 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  34.83 
 
 
718 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  33.52 
 
 
694 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  33.85 
 
 
698 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  33.85 
 
 
698 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  33.85 
 
 
732 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  31.4 
 
 
697 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  33.86 
 
 
776 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  33.86 
 
 
776 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  31.35 
 
 
697 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  33.86 
 
 
772 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  33.86 
 
 
782 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.47 
 
 
702 aa  320  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  31.32 
 
 
793 aa  319  9e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  31.37 
 
 
701 aa  319  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  31.49 
 
 
697 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.47 
 
 
721 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.47 
 
 
721 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  34.14 
 
 
748 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  31.35 
 
 
697 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.42 
 
 
707 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.57 
 
 
770 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  31.26 
 
 
697 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.14 
 
 
703 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
697 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.29 
 
 
767 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.9 
 
 
721 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33 
 
 
712 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  43.08 
 
 
682 aa  203  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  37.62 
 
 
679 aa  203  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  40.15 
 
 
688 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  40.15 
 
 
688 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  37.17 
 
 
701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  40.42 
 
 
714 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  35.67 
 
 
726 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  41.76 
 
 
685 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  36.71 
 
 
677 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
689 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  29.59 
 
 
703 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  36.84 
 
 
730 aa  194  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  32.94 
 
 
689 aa  194  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  40.38 
 
 
704 aa  193  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  39.18 
 
 
695 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  26.04 
 
 
700 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  36.66 
 
 
724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  35.59 
 
 
745 aa  190  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  37.55 
 
 
703 aa  190  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  35.81 
 
 
708 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  35.98 
 
 
719 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  36.49 
 
 
719 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  36.84 
 
 
688 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  33.06 
 
 
719 aa  187  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  31.84 
 
 
718 aa  187  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  30.91 
 
 
727 aa  187  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  38.63 
 
 
690 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  40.83 
 
 
713 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  37.18 
 
 
707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  35.83 
 
 
727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  35.33 
 
 
727 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  35.83 
 
 
727 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  35.2 
 
 
685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  35.83 
 
 
726 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  35.33 
 
 
727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  35.83 
 
 
714 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  35.33 
 
 
727 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  41.27 
 
 
697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>