175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1154 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  93.33 
 
 
120 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.59 
 
 
849 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.5 
 
 
844 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  41.74 
 
 
847 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.87 
 
 
847 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  40.87 
 
 
847 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  39.83 
 
 
856 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.74 
 
 
846 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  38.32 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  34.67 
 
 
855 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  40.54 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  35.88 
 
 
842 aa  77.4  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  43.88 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  32.71 
 
 
822 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
602 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  43.88 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  37.04 
 
 
844 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  37.93 
 
 
856 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  42 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.34 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  38.39 
 
 
1096 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
1111 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  39.81 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  34.78 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  39.81 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  35.92 
 
 
852 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
1096 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  36.11 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  42.7 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  42.57 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  40.82 
 
 
126 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  38 
 
 
120 aa  62  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  41.24 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
121 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  37.61 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  36.13 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
631 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
115 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
126 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  29.92 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  33.33 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  35.92 
 
 
123 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  35.65 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  30 
 
 
133 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  38.38 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
559 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  39.53 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  33.01 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  32.04 
 
 
126 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 
429 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  37.66 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  33.71 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  30.47 
 
 
126 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  34.86 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
122 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2263  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.36 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.911956  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  29.66 
 
 
129 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  32.52 
 
 
119 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
125 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  34.02 
 
 
124 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  32.08 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  30.28 
 
 
207 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  29.82 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  33.05 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2230  response regulator receiver domain-containing protein  36.73 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  32.08 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  30.28 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  31.13 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0906  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.73 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  29.66 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  32.41 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  31.13 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  31.36 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  33.98 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  27.97 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  31.4 
 
 
265 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.58 
 
 
384 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.35 
 
 
651 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
123 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  31.19 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  32.28 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
639 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  25.98 
 
 
1122 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  32.04 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>