More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1142 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  95.24 
 
 		 294 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  85.03 
 
 		 294 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  81.63 
 
 		 294 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  73.13 
 
 		 293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  71.77 
 
 		 293 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  71.77 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  72.11 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  72.7 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  72.7 
 
 		 295 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  72.35 
 
 		 290 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  68.37 
 
 		 291 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  70.99 
 
 		 299 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  69.28 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  69.28 
 
 		 291 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  63.14 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  65.87 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  66.1 
 
 		 296 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  66.44 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  65.76 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  63.27 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  64.51 
 
 		 296 aa  362  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  63.82 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  62.8 
 
 		 300 aa  359  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  57.53 
 
 		 297 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 		 299 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  65.19 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  63.82 
 
 		 296 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 296 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 319 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  63.48 
 
 		 296 aa  338  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  57.53 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  58.84 
 
 		 293 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  61.64 
 
 		 297 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  55.25 
 
 		 296 aa  315  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  54.76 
 
 		 293 aa  301  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  53.56 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  58.09 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  54.08 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  51.66 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  46.44 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  48.25 
 
 		 287 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 298 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  47.28 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  45.82 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>