More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1137 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  96.23 
 
 
371 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
371 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  43.82 
 
 
376 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  42.86 
 
 
369 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  40.91 
 
 
378 aa  292  5e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  39.84 
 
 
377 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.87 
 
 
377 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  41.87 
 
 
377 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  40.16 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  41.87 
 
 
377 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  40.44 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  40.21 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 
388 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  40.16 
 
 
371 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  40.32 
 
 
373 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  39.14 
 
 
377 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  39.28 
 
 
359 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  40.65 
 
 
373 aa  268  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  38.07 
 
 
377 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  39.57 
 
 
382 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  45.98 
 
 
372 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  39.73 
 
 
380 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38.75 
 
 
382 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  35.73 
 
 
390 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 
372 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  37.5 
 
 
367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 
394 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  37.15 
 
 
367 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 
389 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
389 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
388 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
391 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 
369 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 
378 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  36.1 
 
 
390 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 
388 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  32.29 
 
 
396 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.81 
 
 
386 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 
393 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.56 
 
 
419 aa  193  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 
413 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 
387 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.71 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
371 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 
396 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
387 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  32.78 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  34.03 
 
 
396 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
409 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  35.08 
 
 
397 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
378 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 
398 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 
397 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 
398 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
418 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.7 
 
 
379 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  31.19 
 
 
409 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 
403 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
382 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  31.54 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
377 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
385 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
397 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
409 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
386 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 
393 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
374 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
374 aa  140  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  29.02 
 
 
383 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 
382 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
382 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
381 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.72 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
382 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.15 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.41 
 
 
377 aa  116  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  31.23 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 
353 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.71 
 
 
349 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.71 
 
 
349 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.99 
 
 
377 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>