More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1078 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  50.27 
 
 
783 aa  684    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
769 aa  1571    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 
784 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  96.1 
 
 
769 aa  1493    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 
774 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  64.63 
 
 
790 aa  1003    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  50.27 
 
 
783 aa  684    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.57 
 
 
772 aa  1070    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  45.41 
 
 
774 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
770 aa  612  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
779 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
782 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  43.96 
 
 
771 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  43.86 
 
 
771 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  42.19 
 
 
773 aa  581  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
769 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
775 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
775 aa  572  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
764 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
797 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  42.88 
 
 
786 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
786 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
795 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
786 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
793 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
600 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
911 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
844 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37 
 
 
773 aa  241  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
661 aa  238  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 
798 aa  231  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  33.66 
 
 
786 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
617 aa  228  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
778 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
523 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  46.96 
 
 
513 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 
511 aa  210  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
512 aa  210  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
505 aa  208  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
562 aa  208  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  46.35 
 
 
503 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
856 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 
513 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
513 aa  207  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
717 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  46.98 
 
 
508 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
1169 aa  204  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
969 aa  204  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  43.87 
 
 
513 aa  203  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  43.87 
 
 
513 aa  203  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
583 aa  203  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
395 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  46.12 
 
 
599 aa  202  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 
502 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
531 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
511 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
1000 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.17 
 
 
532 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
530 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
927 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  45.6 
 
 
288 aa  198  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
1501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
989 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
989 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  45.56 
 
 
511 aa  197  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
579 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  45.22 
 
 
525 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
620 aa  196  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
389 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
377 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
536 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
533 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
511 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  41.39 
 
 
470 aa  194  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
1138 aa  194  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  43.95 
 
 
511 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
1135 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 
1274 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
594 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  41.37 
 
 
470 aa  192  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
456 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
536 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
974 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
468 aa  191  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
605 aa  190  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
575 aa  190  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
846 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
917 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 
587 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
1276 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
643 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  29.62 
 
 
685 aa  188  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
627 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
1296 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
646 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  37.78 
 
 
1410 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 
791 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
1038 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>