More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1053 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  100 
 
 
319 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  69.5 
 
 
321 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.41 
 
 
315 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  66.25 
 
 
320 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  67.92 
 
 
321 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.77 
 
 
318 aa  417  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  68.34 
 
 
321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  68.34 
 
 
321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  57.68 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.49 
 
 
324 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.49 
 
 
324 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 
335 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.8 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.68 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  52.22 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
340 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
341 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 
328 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.55 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
343 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 
333 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  50 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.38 
 
 
339 aa  265  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
341 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
339 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
331 aa  258  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
331 aa  255  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
320 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
339 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.35 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
322 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 
313 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
318 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  43.9 
 
 
329 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
327 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.77 
 
 
325 aa  225  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.55 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
310 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
326 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
338 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.95 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
317 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
307 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
312 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
304 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
320 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  39.04 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
307 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  40.2 
 
 
300 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
326 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
302 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.12 
 
 
288 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  40.13 
 
 
306 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  34.63 
 
 
309 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  35.02 
 
 
309 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
303 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  38.33 
 
 
300 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  35.41 
 
 
309 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.13 
 
 
305 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 
300 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  34.63 
 
 
309 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
299 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
298 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.44 
 
 
288 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  37.86 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  38.28 
 
 
661 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
303 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
315 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
305 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
305 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
304 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
327 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
303 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
305 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  37.04 
 
 
300 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  34.69 
 
 
311 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
312 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.75 
 
 
284 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>