More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0998 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
137 aa  289  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  96.35 
 
 
137 aa  282  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  80.49 
 
 
141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  68.5 
 
 
130 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
146 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 
151 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  62.7 
 
 
159 aa  183  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  57.46 
 
 
136 aa  183  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  63.78 
 
 
135 aa  180  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  63.71 
 
 
132 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  59.84 
 
 
134 aa  176  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  61.9 
 
 
132 aa  175  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  61.24 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 
136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 
133 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 
139 aa  168  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 
132 aa  168  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  59.35 
 
 
135 aa  167  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
167 aa  167  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 
128 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
155 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  57.58 
 
 
133 aa  164  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 
185 aa  164  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
133 aa  164  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 
133 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  59.02 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  60.32 
 
 
137 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 
131 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
140 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  53.44 
 
 
189 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  56.72 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 
131 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.91 
 
 
131 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 
131 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 
131 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 
177 aa  158  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  53.68 
 
 
137 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
131 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  52.67 
 
 
138 aa  157  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 
133 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
131 aa  157  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  51.82 
 
 
138 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 
506 aa  156  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
131 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 
141 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  54.81 
 
 
150 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  53.73 
 
 
136 aa  155  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  54.76 
 
 
141 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 
140 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 
180 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
135 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 
134 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  58.62 
 
 
141 aa  154  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 
136 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 
137 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  61.74 
 
 
127 aa  154  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.45 
 
 
144 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  50.74 
 
 
167 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 
171 aa  153  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
166 aa  153  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 
134 aa  153  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 
140 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 
163 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
137 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  57.02 
 
 
135 aa  151  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 
177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  49.63 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  55.04 
 
 
134 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
137 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 
134 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 
167 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  53.17 
 
 
135 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 
198 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 
183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
131 aa  150  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 
132 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  51.2 
 
 
136 aa  149  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 
131 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
165 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 
130 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 
150 aa  149  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  56.78 
 
 
137 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 
132 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
140 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
133 aa  148  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
140 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>