More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0820 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1751  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.65 
 
 		 330 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  34.01 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  33.98 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  32.28 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 432 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.68 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.55 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.93 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  33.76 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2520  putative transcriptional regulator  35.66 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2704  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.613515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 326 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>