More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0711 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  100 
 
 
495 aa  979    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  46.37 
 
 
494 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  45.95 
 
 
525 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  48.08 
 
 
511 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  48.08 
 
 
511 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  45.64 
 
 
513 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.03 
 
 
516 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.56 
 
 
495 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.71 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 
511 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.42 
 
 
497 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.06 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  48.49 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
523 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
523 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
523 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.71 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.2 
 
 
513 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
507 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  46.06 
 
 
500 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 
504 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
504 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
507 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  47.85 
 
 
505 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 
503 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.92 
 
 
506 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.67 
 
 
504 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.61 
 
 
504 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.22 
 
 
495 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  44.04 
 
 
497 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.57 
 
 
516 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.72 
 
 
495 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
507 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 
512 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 
494 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.26 
 
 
501 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 
520 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.45 
 
 
517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  43.18 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.31 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 
516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.25 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  42.86 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.95 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.04 
 
 
501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  44.6 
 
 
509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  44.02 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.87 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  40.81 
 
 
506 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.18 
 
 
503 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.95 
 
 
513 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.36 
 
 
524 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  45.24 
 
 
525 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 
504 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  42.89 
 
 
525 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  43.81 
 
 
498 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
522 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
512 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
506 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  46.15 
 
 
519 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
506 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  42.18 
 
 
505 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.18 
 
 
503 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.36 
 
 
524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.81 
 
 
514 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.4 
 
 
520 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.38 
 
 
511 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.18 
 
 
503 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.36 
 
 
524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.81 
 
 
514 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  42.36 
 
 
503 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 
506 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
506 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.17 
 
 
501 aa  405  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
506 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.81 
 
 
514 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.61 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.16 
 
 
503 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 
527 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.55 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  43.88 
 
 
500 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.47 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.71 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.36 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.51 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.9 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>