More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0677 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  100 
 
 
290 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  95.17 
 
 
290 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  84.78 
 
 
290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  76.55 
 
 
290 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  78.62 
 
 
290 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  71.88 
 
 
289 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  71.53 
 
 
289 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  61.67 
 
 
289 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  60 
 
 
290 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  61.51 
 
 
286 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  58.28 
 
 
290 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  60.85 
 
 
290 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  60.98 
 
 
289 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  58.62 
 
 
290 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  63.41 
 
 
289 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  61.15 
 
 
284 aa  309  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  59.93 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  60.07 
 
 
284 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  60.43 
 
 
284 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  59.52 
 
 
291 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  58.28 
 
 
290 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  54.58 
 
 
299 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  60.14 
 
 
291 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  64.64 
 
 
290 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  54.58 
 
 
294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  60.15 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  57.84 
 
 
288 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  60.49 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  55.99 
 
 
296 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  58.68 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  56.41 
 
 
293 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  54.74 
 
 
288 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  58.68 
 
 
295 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  58.68 
 
 
295 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  55.28 
 
 
287 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  57.24 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  56.29 
 
 
288 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  57.41 
 
 
288 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  50.18 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  53.85 
 
 
288 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  48.94 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  60.29 
 
 
295 aa  198  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.87 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.45 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  36.43 
 
 
278 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  36.43 
 
 
278 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 
277 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.93 
 
 
304 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  37.32 
 
 
289 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
288 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 
278 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.25 
 
 
288 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.88 
 
 
288 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  35.31 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.88 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.88 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  35.92 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 
303 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.46 
 
 
281 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  33.46 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.45 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.08 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  39.36 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  34.66 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.93 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.26 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.26 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.26 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.97 
 
 
285 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  36.2 
 
 
280 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  35.02 
 
 
281 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  29.37 
 
 
294 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.11 
 
 
285 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  31.21 
 
 
285 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  30.88 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.49 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.49 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  31.27 
 
 
291 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.05 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  32.68 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  35.9 
 
 
303 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  30.48 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  28.73 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  30.18 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  28.83 
 
 
285 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  28.46 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.13 
 
 
290 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  31.99 
 
 
285 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.63 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.63 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  29.29 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  33.45 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  32.47 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.35 
 
 
287 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.32 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  30.53 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  28.99 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  32.96 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.2 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>