24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0663 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  265  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  42.52 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5802  hypothetical protein  37.88 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  34.35 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  32.12 
 
 
144 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  34.43 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  34.43 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  31.15 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  31.11 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  33.61 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  33.06 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2316  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.2 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  28.03 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.54 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  30.25 
 
 
133 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4660  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  28 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  27.56 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2315  hypothetical protein  28.23 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  26.61 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  29.13 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>