More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0619 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
379 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
375 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  35.28 
 
 
391 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  34.63 
 
 
395 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  47.15 
 
 
396 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
442 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
393 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
570 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
397 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  45.69 
 
 
403 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.02 
 
 
394 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 
405 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
373 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  38.82 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  60 
 
 
757 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4077  putative PAS/PAC sensor protein  62.5 
 
 
135 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  36.06 
 
 
471 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3852  putative PAS/PAC sensor protein  53.03 
 
 
391 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.83404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
734 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
390 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
376 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  36.8 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
595 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
618 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  38.12 
 
 
387 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
621 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
376 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  36.7 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  36.36 
 
 
371 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  35.5 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  36.36 
 
 
405 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  36.48 
 
 
373 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  36.36 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  37 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  36.56 
 
 
373 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  35.56 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  35.42 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  33.48 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  35.56 
 
 
377 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  35.4 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
460 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  50.38 
 
 
427 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
557 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  36.09 
 
 
447 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
370 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  49.23 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
384 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
912 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
1084 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
368 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  44.09 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  42.66 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  42.66 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  34.7 
 
 
728 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  41.96 
 
 
393 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  32.38 
 
 
383 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
776 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  45.3 
 
 
456 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  33.64 
 
 
728 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  33.76 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
776 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2483  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  25.99 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
412 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  27.96 
 
 
385 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.86 
 
 
584 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  32 
 
 
1131 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  29.19 
 
 
372 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  29.35 
 
 
414 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
407 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
989 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
644 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  30.34 
 
 
586 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
564 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
451 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
377 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  25.56 
 
 
1046 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  29.18 
 
 
364 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
510 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  30.74 
 
 
1111 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
1043 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
695 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
568 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
511 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
955 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  30.26 
 
 
427 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
461 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
541 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 
902 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01510  two-component system sensor histidine kinase  26.88 
 
 
813 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.683286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
708 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
590 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
639 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>