153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0569 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  93.25 
 
 		 258 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  72.11 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  67.78 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  58.3 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  55.1 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  57.14 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  57.14 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  55.1 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  37.8 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  43.46 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  37.45 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  36.99 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  44.3 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  37.4 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  40.09 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  42.17 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  45.18 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  41.88 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  40 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  39.67 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  44.78 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  41.43 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  32.14 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  32.33 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  38.86 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  32.53 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.53 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  35.9 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  33.06 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  31.54 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  26.29 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  30.99 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  28.21 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  28.99 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  35.17 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  31.62 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  36.52 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  27.76 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  29.22 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  22.98 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.39 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.43 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.67 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  25.74 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  25 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  28.63 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  28.82 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.49 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  21.97 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.22 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  28.45 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  25.24 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  28.44 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  24.15 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  23.9 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  24.41 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  28.64 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  23.61 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.11 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  25.73 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  27.01 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  22.17 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  19.53 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  23.66 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  22.58 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  25.2 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  25.2 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  19.07 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  23.53 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  20.18 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  24.8 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  24.8 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  24.32 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1571  hypothetical protein  23.53 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  21.26 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  27.87 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  18.43 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1719  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.78 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  24.5 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.04 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  21.3 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  31.93 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  27.01 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.98 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.25 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  33.68 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1827  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.84 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  20.63 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  19.57 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  21.3 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>