172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0480 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
1029 aa  2004    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  43.1 
 
 
2003 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.05 
 
 
1119 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  40.56 
 
 
1550 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.78 
 
 
1227 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.05 
 
 
995 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.88 
 
 
1011 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  37.6 
 
 
986 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.19 
 
 
972 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.54 
 
 
1285 aa  355  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  38.24 
 
 
2365 aa  354  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  38.24 
 
 
2346 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  38.94 
 
 
2396 aa  350  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  33.68 
 
 
1519 aa  349  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  38.47 
 
 
650 aa  347  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  35.01 
 
 
1881 aa  346  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  36.49 
 
 
1782 aa  343  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.35 
 
 
1848 aa  340  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.88 
 
 
919 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.51 
 
 
1508 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  37.4 
 
 
2371 aa  332  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  36.49 
 
 
2366 aa  330  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 
1164 aa  315  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  37.52 
 
 
1055 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.93 
 
 
3506 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  36.07 
 
 
1004 aa  300  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  38.61 
 
 
1001 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  37.3 
 
 
1001 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  36.05 
 
 
1033 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  43.6 
 
 
1056 aa  293  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  35.94 
 
 
1333 aa  293  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.01 
 
 
1028 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  37.64 
 
 
677 aa  288  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  36.47 
 
 
1038 aa  287  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.86 
 
 
3954 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  38.26 
 
 
1053 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.06 
 
 
983 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  35.36 
 
 
1129 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  35.36 
 
 
1131 aa  283  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  35.22 
 
 
1129 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  35.22 
 
 
1131 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  35.22 
 
 
1131 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  35.22 
 
 
1131 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.02 
 
 
990 aa  278  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  35.5 
 
 
1131 aa  278  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  33.68 
 
 
4238 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.53 
 
 
4238 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  34.56 
 
 
1130 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.53 
 
 
3822 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.43 
 
 
991 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  36.25 
 
 
995 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  35.92 
 
 
1062 aa  248  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  34.03 
 
 
1006 aa  246  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.43 
 
 
1125 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.99 
 
 
985 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.9 
 
 
994 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  33.15 
 
 
1152 aa  210  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  36.05 
 
 
1011 aa  210  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  35.77 
 
 
1016 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.32 
 
 
2711 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  35.1 
 
 
860 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.07 
 
 
816 aa  182  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.92 
 
 
1532 aa  179  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 
980 aa  178  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  30.55 
 
 
1180 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.02 
 
 
1081 aa  155  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  35.42 
 
 
488 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 
407 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.57 
 
 
3629 aa  131  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  28.96 
 
 
1459 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  28.35 
 
 
1078 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  27.69 
 
 
814 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.01 
 
 
1489 aa  125  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  28.38 
 
 
1458 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 
1769 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.71 
 
 
2407 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.52 
 
 
1322 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  26.98 
 
 
1019 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.46 
 
 
926 aa  99.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.14 
 
 
910 aa  98.2  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.54 
 
 
2926 aa  96.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  43.02 
 
 
987 aa  96.3  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  37.14 
 
 
1111 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  36.27 
 
 
1130 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  42.61 
 
 
1108 aa  91.3  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.92 
 
 
907 aa  90.9  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.7 
 
 
1177 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.44 
 
 
915 aa  85.9  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  28.25 
 
 
942 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  24.35 
 
 
1066 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  40.67 
 
 
1971 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  39.66 
 
 
3420 aa  81.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  39.66 
 
 
3415 aa  81.6  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.94 
 
 
2363 aa  81.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  40.46 
 
 
852 aa  80.9  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  32.19 
 
 
1571 aa  80.5  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  38.95 
 
 
882 aa  80.1  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.13 
 
 
1530 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  34.51 
 
 
1806 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1593 aa  75.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>