More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0472 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
433 aa  870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  90.93 
 
 
520 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  70.84 
 
 
603 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  73.9 
 
 
509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  68.1 
 
 
504 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  65.01 
 
 
498 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  64.74 
 
 
498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  68.09 
 
 
413 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  55.96 
 
 
375 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  56.74 
 
 
380 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  55.96 
 
 
375 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  62.04 
 
 
376 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  62.35 
 
 
367 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  57.55 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  59.38 
 
 
355 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  60.37 
 
 
360 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  60.82 
 
 
331 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  58.41 
 
 
441 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  58.57 
 
 
366 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  58.33 
 
 
355 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  58.13 
 
 
325 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  57.81 
 
 
358 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  48.04 
 
 
446 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  54.83 
 
 
389 aa  320  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 
375 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  54.38 
 
 
378 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  49.85 
 
 
373 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 
435 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  52.49 
 
 
355 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 
399 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  47.93 
 
 
378 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  46.78 
 
 
393 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  47.93 
 
 
378 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  45.4 
 
 
378 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  47.76 
 
 
364 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  46.06 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  42.21 
 
 
393 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  48.15 
 
 
363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  45.83 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  46.91 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  33.02 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  31.42 
 
 
549 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  36.91 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.13 
 
 
513 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
500 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  29.13 
 
 
500 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  31.9 
 
 
513 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  35.65 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  28.03 
 
 
507 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  33.02 
 
 
318 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  35 
 
 
311 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.16 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  31.99 
 
 
319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  34.84 
 
 
300 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  32.75 
 
 
568 aa  127  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  33.84 
 
 
311 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 
310 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
311 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.02 
 
 
511 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  34.92 
 
 
353 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.65 
 
 
304 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.72 
 
 
510 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
296 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  35.56 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  34.71 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
502 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  33.45 
 
 
333 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  30.35 
 
 
308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  28.88 
 
 
523 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
550 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  29.47 
 
 
301 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  29.97 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.23 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 
323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 
308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  28.31 
 
 
519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  32.08 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  28.03 
 
 
506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  24.69 
 
 
299 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.66 
 
 
531 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  32.39 
 
 
315 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  29.19 
 
 
539 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  32.54 
 
 
320 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  31.38 
 
 
500 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  27.71 
 
 
531 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  27.33 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  27.66 
 
 
531 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  33 
 
 
314 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 
312 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  32.43 
 
 
313 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.21 
 
 
498 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  30.32 
 
 
520 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>