More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0454 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0454  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
299 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797965  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.49 
 
 
652 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
616 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
499 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
812 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
1523 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.6 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.21 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
679 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
624 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
235 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
1739 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
350 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.68 
 
 
2401 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
266 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  22.95 
 
 
1119 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
455 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
930 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.68 
 
 
860 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
1523 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2185  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.35 
 
 
466 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
898 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
774 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  28.57 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
1162 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
1038 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
379 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.71 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  25.12 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
898 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
480 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.85 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.24 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
345 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
727 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
373 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 
785 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
1301 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3563  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.03489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
340 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  21.79 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
311 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
974 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 
316 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
340 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
824 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2791  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
277 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 
1032 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.21 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
584 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  31.18 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
1075 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 
1035 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.79 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
884 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
1562 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
892 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1813  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.37725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  32.26 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
224 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.51 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>