97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0387 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  98.01 
 
 		 453 aa  905    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  67.77 
 
 		 451 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  73.73 
 
 		 452 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 453 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  70.86 
 
 		 452 aa  678    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  66.3 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  63.88 
 
 		 450 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  63.29 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  61.81 
 
 		 544 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  62.69 
 
 		 449 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  62.84 
 
 		 450 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  57.67 
 
 		 452 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  59.15 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  40.1 
 
 		 432 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  40.35 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 		 457 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  40 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  37.47 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  37.64 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  38.59 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  36.21 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  35.27 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  35.53 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  34 
 
 		 448 aa  249  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  33.62 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  36.32 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33 
 
 		 448 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.36 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  32.23 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 447 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  20.94 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.52 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  26.92 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  24.6 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.22 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 432 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.18 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.23 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  27.43 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0247417 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.33 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>