More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0315 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  99.29 
 
 
141 aa  285  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  44 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  42.47 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
151 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  44.14 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  44.14 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  44.14 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  43.57 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
146 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  42.96 
 
 
146 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  43.06 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.26 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  46.97 
 
 
148 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
145 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  40 
 
 
154 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  41.61 
 
 
139 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  40.74 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
154 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
152 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  41.13 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
153 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  43.28 
 
 
149 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  40.67 
 
 
150 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
149 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
150 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
149 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  40.74 
 
 
148 aa  104  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  40 
 
 
146 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
147 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.42 
 
 
146 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  44.27 
 
 
139 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
150 aa  103  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.74 
 
 
148 aa  103  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  40 
 
 
143 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  40 
 
 
144 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  39.31 
 
 
150 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
149 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
152 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
151 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  40.94 
 
 
137 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
143 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  39.06 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  39.39 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  41.04 
 
 
153 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  34.9 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  37.23 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.41 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  39.42 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  35.21 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  40.94 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  41.04 
 
 
160 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  37.96 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  34.04 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  36.69 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  44.52 
 
 
173 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.69 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  38.64 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  40 
 
 
162 aa  95.9  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.81 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  36.36 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.81 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  40.8 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  40.94 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.5 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  39.23 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  37.31 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  40.3 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  37.23 
 
 
145 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
146 aa  93.6  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  37.78 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>