More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0312 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
301 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.17 
 
 
297 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  70.11 
 
 
281 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  58.02 
 
 
299 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  58.06 
 
 
281 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  58.06 
 
 
281 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 
328 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  32.25 
 
 
325 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  34.51 
 
 
296 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  37.27 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  39.55 
 
 
325 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  33.1 
 
 
311 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
290 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  30.03 
 
 
297 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
295 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
302 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  32.01 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  29.49 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  26.47 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  26.47 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  30.31 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  26.47 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  26.47 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.74 
 
 
302 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  32.26 
 
 
305 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  25.91 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.74 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  30.41 
 
 
310 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  25.74 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  28.1 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  27.43 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  25.91 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.08 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  29.69 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.44 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  30.18 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  29.01 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.4 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.4 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  28.83 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  28.83 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  28.83 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  28.83 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  28.83 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  28.83 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  28.63 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.69 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  27.08 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  28.47 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  27.31 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  24.92 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  26.79 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  24.09 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  33.21 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  27.95 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.38 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  26.57 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  25.95 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  28.63 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  30.33 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.64 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  27.5 
 
 
353 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.69 
 
 
397 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.72 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  25.45 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  26.69 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  25.74 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  28.09 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.45 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  28.98 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>