43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0305 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  500  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  32.78 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  30.04 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  32.79 
 
 
1072 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.28 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  27.45 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  26.86 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  28.65 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  28.49 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  27.5 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  24.12 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.64 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  29.41 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  31.86 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  26.35 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  31.69 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  28.92 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  30.34 
 
 
152 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  25.6 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  24.71 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 
447 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0019  putative acetylhydrolase  29.75 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.211042 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  27.42 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  38.37 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  28.65 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1563  lipolytic protein G-D-S-L family  32.35 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  26.35 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  26.74 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  34.12 
 
 
424 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  25.14 
 
 
593 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  26.01 
 
 
871 aa  48.5  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  25.28 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  24.74 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  35.21 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  25.89 
 
 
593 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47870  predicted protein  24.57 
 
 
402 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.504417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  32.46 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0603  GDSL family lipase  30.7 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  0.0431523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  27.73 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  24.22 
 
 
648 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  23.35 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  23.84 
 
 
216 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>