More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0282 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.78 
 
 
241 aa  457  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.75 
 
 
247 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  50 
 
 
248 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  48.96 
 
 
245 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  48.75 
 
 
246 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  51.02 
 
 
252 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 
245 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  50 
 
 
241 aa  220  1e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  50 
 
 
241 aa  220  1e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  50 
 
 
241 aa  220  1e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  218  8e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  47.48 
 
 
245 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
243 aa  212  3e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  48.96 
 
 
248 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  41.42 
 
 
242 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
242 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
242 aa  174  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
259 aa  172  6e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
267 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
267 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
255 aa  162  4e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
265 aa  162  4e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
252 aa  161  8e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
256 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
254 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
250 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
256 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
256 aa  154  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
256 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
254 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
255 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
254 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
251 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
255 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
256 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2891  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
242 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000353377  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
252 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
250 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.51 
 
 
254 aa  147  1e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
235 aa  147  1e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
260 aa  147  1e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
254 aa  147  2e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
248 aa  146  4e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0423365  hitchhiker  0.00643231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
254 aa  144  8e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
248 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
249 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
251 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
249 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
257 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
269 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
257 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  33.07 
 
 
269 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
257 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4208  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.42 
 
 
248 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01396  hypothetical protein  34.25 
 
 
273 aa  141  1e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
260 aa  141  1e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1097  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.42 
 
 
248 aa  140  1e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
246 aa  141  1e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
260 aa  140  2e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
263 aa  140  2e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
255 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
252 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
255 aa  139  4e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
259 aa  139  4e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
252 aa  139  5e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.686314  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
257 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
257 aa  138  8e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
270 aa  138  8e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.08 
 
 
251 aa  138  9e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
263 aa  138  9e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
265 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.32 
 
 
256 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
247 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
251 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
246 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
263 aa  136  3e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
246 aa  136  3e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
247 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
247 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  34.68 
 
 
261 aa  135  7e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
267 aa  135  7e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
250 aa  135  7e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
258 aa  135  7e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>