294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0235 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  90.81 
 
 
187 aa  350  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  52.75 
 
 
183 aa  201  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  43.09 
 
 
179 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.16 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
183 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  39.34 
 
 
178 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.96 
 
 
181 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
181 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.41 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  32.98 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.3 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.36 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  36.7 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.05 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.23 
 
 
179 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.26 
 
 
183 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.17 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  36.17 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
178 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  35.52 
 
 
180 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.78 
 
 
221 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
186 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
199 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
199 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 
177 aa  104  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
189 aa  104  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
187 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 
189 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 
183 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.78 
 
 
178 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
204 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.22 
 
 
221 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
190 aa  101  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  36.73 
 
 
221 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 
201 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.6 
 
 
193 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.36 
 
 
178 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
181 aa  98.2  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.02 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  35.9 
 
 
198 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 
188 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
219 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
183 aa  92  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
200 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.67 
 
 
204 aa  91.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
201 aa  91.3  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  34.03 
 
 
187 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  30.5 
 
 
196 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.2 
 
 
228 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 
217 aa  88.6  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.34 
 
 
209 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
219 aa  87.8  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
194 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
189 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
178 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
187 aa  87  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  31.87 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.49 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  42.31 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  30.93 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.31 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>