More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0099 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  100 
 
 
506 aa  1021    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.31 
 
 
510 aa  941    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  65.32 
 
 
474 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.17 
 
 
493 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  50 
 
 
541 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.4 
 
 
508 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  50.22 
 
 
541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.45 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
492 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
492 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  43.79 
 
 
492 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.22 
 
 
495 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  45.93 
 
 
495 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
506 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
504 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  43.54 
 
 
491 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
519 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
538 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
498 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
467 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
461 aa  322  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 
478 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  42.05 
 
 
478 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
466 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
466 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
495 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  40.13 
 
 
494 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
496 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
465 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  39.91 
 
 
511 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
488 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
484 aa  279  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
502 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
478 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
465 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
422 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.75 
 
 
747 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.75 
 
 
747 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
494 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
1519 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
391 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
543 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  30.36 
 
 
367 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
518 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
495 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  28.74 
 
 
613 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.62 
 
 
490 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  26.77 
 
 
499 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
622 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2449  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.95 
 
 
365 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000168694  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.63 
 
 
365 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
390 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.2 
 
 
747 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  26.67 
 
 
1000 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  27 
 
 
975 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
396 aa  87.4  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
480 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  27.05 
 
 
484 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
654 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  25.82 
 
 
510 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.57 
 
 
457 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
766 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  28.87 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.27 
 
 
578 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.35 
 
 
752 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  28.4 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  26.85 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  27.25 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.6 
 
 
546 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.3 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
608 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  29.74 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
630 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.45 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.06 
 
 
491 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  30.4 
 
 
573 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  26.02 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
346 aa  84  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
652 aa  84  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
713 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  25 
 
 
558 aa  83.2  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
504 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
524 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
680 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  25.87 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  30.49 
 
 
617 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
376 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  30.13 
 
 
1347 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
785 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>