129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0096 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  100 
 
 
133 aa  266  9e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  93.23 
 
 
133 aa  246  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  69.53 
 
 
132 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  68.22 
 
 
129 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  56.1 
 
 
145 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  55.56 
 
 
145 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  54.62 
 
 
141 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  47.5 
 
 
121 aa  103  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  56.88 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  40.5 
 
 
150 aa  77.4  6e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  40 
 
 
138 aa  69.3  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  50.7 
 
 
227 aa  68.6  3e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  37.59 
 
 
189 aa  67.4  7e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  39.18 
 
 
132 aa  65.5  2e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  37.07 
 
 
148 aa  65.9  2e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  39.69 
 
 
141 aa  64.3  5e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 
130 aa  60.8  6e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  37.17 
 
 
240 aa  60.8  6e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  42.42 
 
 
116 aa  58.9  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
136 aa  58.9  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  42.17 
 
 
154 aa  59.3  2e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 
106 aa  58.5  3e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  40.4 
 
 
116 aa  58.2  3e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.75953e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  41.49 
 
 
145 aa  57.8  5e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 
149 aa  57.4  7e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
111 aa  57  9e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  57  9e-08  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  8.77288e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  43.75 
 
 
109 aa  56.2  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  42.11 
 
 
111 aa  56.6  1e-07  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.76815e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  48.44 
 
 
129 aa  56.2  2e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  38.78 
 
 
137 aa  55.5  2e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  38.05 
 
 
242 aa  55.5  2e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  37.27 
 
 
119 aa  55.8  2e-07  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31.31 
 
 
115 aa  55.1  3e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  41.18 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  52.63 
 
 
95 aa  54.3  6e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  38.16 
 
 
121 aa  53.9  7e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  41.57 
 
 
180 aa  53.9  7e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 
113 aa  53.5  8e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  41.01 
 
 
165 aa  53.5  8e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  41.01 
 
 
165 aa  53.5  8e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 
137 aa  53.5  9e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 
169 aa  53.5  9e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.38 
 
 
115 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 
137 aa  53.1  1e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
162 aa  52.8  1e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40 
 
 
114 aa  53.1  1e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.43 
 
 
119 aa  52.8  2e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.02449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  45.63 
 
 
113 aa  52.8  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.43 
 
 
119 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.43 
 
 
115 aa  52.4  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.43 
 
 
119 aa  52.8  2e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.43 
 
 
119 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.60819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.38 
 
 
115 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.43 
 
 
119 aa  52.8  2e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.43 
 
 
115 aa  52  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
131 aa  51.6  3e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 
123 aa  52  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30.3 
 
 
115 aa  51.6  4e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  47.76 
 
 
122 aa  50.8  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  2.86956e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  36.62 
 
 
116 aa  49.7  1e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.05817e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  36.84 
 
 
116 aa  49.3  2e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.8083e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  40.34 
 
 
174 aa  48.9  2e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  36.54 
 
 
126 aa  48.9  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.13724e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 
110 aa  49.3  2e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 
121 aa  49.3  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.31452e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
125 aa  48.5  3e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  6.17506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  34.74 
 
 
131 aa  48.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  40 
 
 
206 aa  48.1  4e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  38 
 
 
130 aa  48.1  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  36.21 
 
 
107 aa  47.8  5e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
125 aa  47.4  6e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  40.24 
 
 
115 aa  47  9e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00185e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  34.78 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  38.89 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  51.06 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  6.01305e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  32.38 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  37.7 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  31.25 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.23477e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  5.12551e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  32.69 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  36.84 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.41875e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  38.82 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  1.34216e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  41.94 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  4.9885e-07  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  38.55 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  31.08 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.04064e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  32.93 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  8.70513e-08  hitchhiker  6.10775e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  31.58 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  25.81 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.99838e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  31.58 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  40.98 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>