More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0095 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.2 
 
 
609 aa  771  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.75 
 
 
610 aa  777  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  93.97 
 
 
597 aa  1149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.15 
 
 
607 aa  764  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  74 
 
 
597 aa  944  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  53.17 
 
 
614 aa  673  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  53.87 
 
 
624 aa  676  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  53.32 
 
 
616 aa  668  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  52.32 
 
 
604 aa  637  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  53.16 
 
 
616 aa  654  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  54.19 
 
 
605 aa  676  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.05 
 
 
609 aa  639  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.58 
 
 
616 aa  657  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
597 aa  1231  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  70.95 
 
 
620 aa  897  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.02 
 
 
614 aa  656  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  55.67 
 
 
617 aa  690  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.08 
 
 
610 aa  778  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  53.05 
 
 
600 aa  633  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.63 
 
 
632 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  51.68 
 
 
609 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.65 
 
 
621 aa  614  1e-174  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.24 
 
 
612 aa  598  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.93 
 
 
622 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.28 
 
 
629 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.92 
 
 
621 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.58 
 
 
595 aa  563  1e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.46 
 
 
623 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.46 
 
 
623 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.89 
 
 
628 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.08 
 
 
606 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.75 
 
 
577 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  43.33 
 
 
592 aa  494  1e-138  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.4 
 
 
635 aa  494  1e-138  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
630 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.92 
 
 
626 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.76 
 
 
608 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 
584 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  42.36 
 
 
589 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.99 
 
 
600 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  42.5 
 
 
601 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.17 
 
 
579 aa  401  1e-110  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.3 
 
 
579 aa  388  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  37.18 
 
 
566 aa  381  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 
569 aa  379  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  32.71 
 
 
556 aa  308  1e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.56 
 
 
567 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  34.6 
 
 
559 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.72 
 
 
542 aa  271  3e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.74 
 
 
537 aa  268  3e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  31.94 
 
 
551 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  2.60158e-09 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
553 aa  266  6e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.23 
 
 
550 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.67 
 
 
550 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13724e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.53 
 
 
536 aa  264  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 
555 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  33.14 
 
 
530 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.21 
 
 
554 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.21 
 
 
554 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  31.4 
 
 
557 aa  260  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  30.58 
 
 
570 aa  259  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 
554 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.82 
 
 
552 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.39 
 
 
552 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.66 
 
 
554 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  30.32 
 
 
545 aa  258  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.06394e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  30.25 
 
 
552 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.47 
 
 
557 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  31.99 
 
 
562 aa  256  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.36 
 
 
542 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.71877e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.82 
 
 
555 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  1e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.19 
 
 
552 aa  256  1e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.19 
 
 
552 aa  256  1e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.19 
 
 
553 aa  255  1e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  2e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
558 aa  255  2e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.51 
 
 
541 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.05334e-05  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.97 
 
 
528 aa  254  4e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.51 
 
 
541 aa  254  4e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.79014e-05  unclonable  4.86692e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.51 
 
 
541 aa  254  4e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.4378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.51 
 
 
541 aa  254  4e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.22788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
545 aa  253  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.4 
 
 
541 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.55464e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  32.42 
 
 
545 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  33.91 
 
 
546 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.4 
 
 
555 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  29.41 
 
 
542 aa  250  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
578 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.98 
 
 
578 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.4 
 
 
553 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38548e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.04 
 
 
536 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  6.98908e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
543 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.79 
 
 
575 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  29.85 
 
 
541 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.58142e-05  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  29.31 
 
 
542 aa  246  7e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  3.98144e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>