More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0090 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 358 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  90.5 
 
 		 358 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  73.29 
 
 		 317 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 		 367 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  43.22 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 878 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 839 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1093 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1093 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 488 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 1253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.77 
 
 		 783 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 551 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 964 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 472 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1714 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 991 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 1390 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 1654 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 681 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.75 
 
 		 1668 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 526 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 941 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 2693 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 788 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 1560 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 732 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.66 
 
 		 1239 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  25.51 
 
 		 754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 1227 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 872 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 932 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 815 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.02 
 
 		 744 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 674 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 945 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  29.48 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.91 
 
 		 1663 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 813 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 856 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 572 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 886 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1047 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 600 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  27.3 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 771 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 771 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.99 
 
 		 1248 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 924 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1210 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1177 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 3706 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.14 
 
 		 676 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 1051 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1246 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 693 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 909 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 648 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 913 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 547 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  23.55 
 
 		 918 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 739 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 892 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1289 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 980 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 682 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  28.17 
 
 		 657 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1182 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 727 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 1676 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 545 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 832 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 698 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 790 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 945 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 936 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>