More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0084 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  87.89 
 
 
256 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  64.96 
 
 
258 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  53.25 
 
 
253 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  55.47 
 
 
260 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  54.29 
 
 
254 aa  244  1e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  48.78 
 
 
253 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  47.13 
 
 
255 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  47.13 
 
 
255 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  45.75 
 
 
253 aa  182  4e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  40.08 
 
 
274 aa  181  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  7.06406e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  45.78 
 
 
253 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  46.94 
 
 
292 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  46.53 
 
 
253 aa  174  1e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  35.08 
 
 
274 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  34.68 
 
 
274 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  42.92 
 
 
267 aa  164  2e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  40.97 
 
 
269 aa  161  8e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  38.52 
 
 
258 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.47 
 
 
284 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.08 
 
 
278 aa  147  2e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  40.43 
 
 
264 aa  145  8e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  36.86 
 
 
282 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  37.55 
 
 
282 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  38.86 
 
 
269 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  37.04 
 
 
253 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  38.75 
 
 
253 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  43.46 
 
 
276 aa  140  1e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  36.68 
 
 
282 aa  141  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  37.55 
 
 
266 aa  140  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  37.12 
 
 
282 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  39.91 
 
 
268 aa  139  4e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  37.45 
 
 
252 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.45 
 
 
255 aa  138  9e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  36.68 
 
 
277 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  38.79 
 
 
252 aa  134  1e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  38.79 
 
 
252 aa  134  1e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  38.79 
 
 
252 aa  134  1e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  38.91 
 
 
259 aa  133  2e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  39.65 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  38.63 
 
 
255 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.32 
 
 
286 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  33.2 
 
 
258 aa  131  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.31 
 
 
289 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  126  4e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.32 
 
 
289 aa  125  8e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  34.66 
 
 
259 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  37.87 
 
 
258 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  36 
 
 
249 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  36.17 
 
 
281 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.66 
 
 
273 aa  120  2e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  32 
 
 
274 aa  120  2e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  37.18 
 
 
425 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  39.5 
 
 
271 aa  119  5e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.33 
 
 
260 aa  119  5e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  40.44 
 
 
295 aa  117  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  39 
 
 
249 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.66 
 
 
294 aa  115  8e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.54 
 
 
278 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  33.99 
 
 
274 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  38.31 
 
 
242 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  35.22 
 
 
274 aa  109  4e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  32.81 
 
 
274 aa  108  7e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  31.78 
 
 
278 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.6 
 
 
278 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  34.69 
 
 
286 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  36.05 
 
 
279 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  32.77 
 
 
278 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  37.45 
 
 
264 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.33 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.94 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  32.55 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  31.95 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  34.18 
 
 
280 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  33.06 
 
 
275 aa  98.6  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.55 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.64 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  32.63 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  32.91 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  33.05 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  33.48 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  36.36 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  33.75 
 
 
278 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  31.3 
 
 
288 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  34.87 
 
 
276 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  34.58 
 
 
273 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  36.73 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  33.06 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  32.48 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  31.62 
 
 
279 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  31.54 
 
 
274 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  32.27 
 
 
287 aa  88.6  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  37.29 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  31.06 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  32.49 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  31.06 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  36.32 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  31.06 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  32.31 
 
 
286 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>