248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0080 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  95.83 
 
 
288 aa  581  1e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  78.25 
 
 
292 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  78.25 
 
 
299 aa  451  1e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  70.74 
 
 
279 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  69.26 
 
 
276 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  69.26 
 
 
279 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  71.48 
 
 
283 aa  381  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  61.07 
 
 
272 aa  354  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  63.84 
 
 
285 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  61.4 
 
 
268 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  61.4 
 
 
274 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  62.41 
 
 
284 aa  339  3e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  60.29 
 
 
268 aa  336  3e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  63.12 
 
 
279 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  57.04 
 
 
291 aa  307  1e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  63.89 
 
 
282 aa  307  1e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  57.14 
 
 
292 aa  303  2e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.11 
 
 
297 aa  291  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  54.24 
 
 
302 aa  283  2e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  52.67 
 
 
305 aa  283  2e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  52.08 
 
 
303 aa  282  5e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.44 
 
 
299 aa  281  7e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  53.57 
 
 
301 aa  274  1e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  53.94 
 
 
287 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  53.94 
 
 
287 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  48.31 
 
 
287 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  50.75 
 
 
288 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  51.38 
 
 
287 aa  270  3e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  45.82 
 
 
287 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  50.79 
 
 
301 aa  262  5e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  48.87 
 
 
288 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  46.62 
 
 
299 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  47.27 
 
 
284 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  51 
 
 
289 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.1 
 
 
270 aa  246  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  46.72 
 
 
288 aa  245  7e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  49.21 
 
 
273 aa  244  2e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  48.47 
 
 
276 aa  243  2e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  46.33 
 
 
285 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  49.2 
 
 
261 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  49.8 
 
 
296 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.21 
 
 
291 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  43.21 
 
 
282 aa  239  3e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
282 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  45.11 
 
 
304 aa  234  1e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  45.52 
 
 
297 aa  233  2e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  45.32 
 
 
275 aa  233  4e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  46.45 
 
 
318 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  45.91 
 
 
292 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  45.91 
 
 
315 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  43.3 
 
 
294 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  45.91 
 
 
292 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  45.55 
 
 
319 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  45.55 
 
 
319 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  45.55 
 
 
319 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.8 
 
 
342 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  40.13 
 
 
342 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  41.11 
 
 
318 aa  200  2e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  43.57 
 
 
251 aa  199  4e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.7 
 
 
271 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.41 
 
 
175 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  54.74 
 
 
147 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  46.67 
 
 
266 aa  165  7e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  47.7 
 
 
273 aa  163  2e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  38.3 
 
 
229 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  48.34 
 
 
244 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  36.47 
 
 
241 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.61 
 
 
247 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  42.26 
 
 
229 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  36.92 
 
 
243 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  47.02 
 
 
239 aa  147  2e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  36.33 
 
 
241 aa  147  2e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  40.49 
 
 
263 aa  147  2e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  40.17 
 
 
269 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  43.27 
 
 
245 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  43.09 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  34.8 
 
 
247 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  38.94 
 
 
263 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  36.32 
 
 
264 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  38.46 
 
 
267 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  34.87 
 
 
317 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  33.75 
 
 
249 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09192e-06 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  41.44 
 
 
247 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  41.44 
 
 
218 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  1.13726e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  47.02 
 
 
220 aa  141  1e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.24566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  39.91 
 
 
242 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  34.88 
 
 
242 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  36.96 
 
 
313 aa  139  4e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  40.56 
 
 
249 aa  139  4e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  40.91 
 
 
242 aa  139  4e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  34.75 
 
 
262 aa  139  5e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.88 
 
 
317 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  41.72 
 
 
252 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  43.71 
 
 
249 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  43.71 
 
 
249 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  39.43 
 
 
283 aa  138  9e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  41.01 
 
 
252 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>