More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0065 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
307 aa  600  1e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  87.75 
 
 
304 aa  466  1e-130  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  69.49 
 
 
297 aa  399  1e-110  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  69.8 
 
 
306 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  72.26 
 
 
301 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.79 
 
 
306 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  71.63 
 
 
320 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.06 
 
 
305 aa  355  7e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.06 
 
 
305 aa  355  7e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  68.36 
 
 
310 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  37.2 
 
 
311 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  40.64 
 
 
314 aa  190  3e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  39.3 
 
 
301 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  37.89 
 
 
319 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.63 
 
 
320 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  36.68 
 
 
290 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  36.33 
 
 
304 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  36.82 
 
 
319 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.48 
 
 
321 aa  153  3e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  35.14 
 
 
305 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  34.75 
 
 
321 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  37.58 
 
 
316 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
301 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  32.17 
 
 
304 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
301 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  135  7e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  34.25 
 
 
297 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.12 
 
 
307 aa  129  4e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  31.31 
 
 
300 aa  130  4e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  34.32 
 
 
303 aa  121  1e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  29.58 
 
 
291 aa  121  1e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 
309 aa  116  4e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.91 
 
 
298 aa  115  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  33.91 
 
 
289 aa  111  2e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  110  4e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  34.62 
 
 
364 aa  108  8e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.3 
 
 
310 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
310 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
310 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.26 
 
 
310 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  31.13 
 
 
308 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
313 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  32.13 
 
 
302 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  32.44 
 
 
308 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  33.22 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  33.22 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  31.58 
 
 
335 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
326 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  29.97 
 
 
310 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.42 
 
 
295 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.44 
 
 
298 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.05 
 
 
294 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.86 
 
 
311 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.54 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.2 
 
 
379 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.54 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.54 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  31.54 
 
 
310 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.02 
 
 
334 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  31.54 
 
 
310 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 
299 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.94 
 
 
302 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  31.72 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  31.54 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.84 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  31.99 
 
 
296 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  99  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  31.99 
 
 
296 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  31.99 
 
 
296 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.11 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.49 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.11 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.81 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  29.68 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.18 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  31.36 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  31.42 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  28.88 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.67 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.65 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  24.91 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  29 
 
 
301 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.48 
 
 
298 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  30.24 
 
 
310 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  31.64 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.69 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.14 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  32.09 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  31.54 
 
 
295 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  32.98 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  32.53 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  30.91 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>