51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0062 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  89.22 
 
 
211 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  53.8 
 
 
186 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  56.25 
 
 
187 aa  184  1e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  44.72 
 
 
216 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  46.41 
 
 
204 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  45.86 
 
 
216 aa  147  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  35.5 
 
 
186 aa  130  1e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  34.78 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  37.89 
 
 
221 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  36.84 
 
 
230 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  38.46 
 
 
219 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  35.42 
 
 
228 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  39.02 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  35.56 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  35.64 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  38.42 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  36.42 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  35.4 
 
 
250 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  35.4 
 
 
246 aa  84.3  1e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  35.85 
 
 
242 aa  82.8  3e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  29.46 
 
 
285 aa  80.1  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  27.65 
 
 
180 aa  79  5e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  33.13 
 
 
223 aa  78.6  7e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  28.65 
 
 
197 aa  78.2  8e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  29.55 
 
 
170 aa  71.2  9e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  26.63 
 
 
163 aa  67.4  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  26.63 
 
 
163 aa  67.4  1e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.62 
 
 
207 aa  64.3  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  27.97 
 
 
212 aa  62  6e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  26.17 
 
 
196 aa  59.3  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  26.84 
 
 
160 aa  59.7  3e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  25.47 
 
 
168 aa  56.2  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  41.79 
 
 
275 aa  55.1  8e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  28.75 
 
 
161 aa  55.1  8e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  29.77 
 
 
169 aa  52.8  4e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.2201e-08 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.46 
 
 
174 aa  52  6e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  26.26 
 
 
224 aa  49.7  3e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  21.38 
 
 
184 aa  49.7  3e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  25.15 
 
 
144 aa  49.3  4e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  26.19 
 
 
199 aa  48.5  7e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.07 
 
 
167 aa  48.1  8e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  24.78 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  28.76 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  25.69 
 
 
180 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.96 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.1507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  34.25 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.75423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  20.67 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  24.87 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.81 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  38.64 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>