More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0060 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  94.94 
 
 
316 aa  603  1e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  59.49 
 
 
319 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.42 
 
 
323 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  50.78 
 
 
331 aa  288  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  50.78 
 
 
331 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  48.82 
 
 
322 aa  282  6e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.45 
 
 
324 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  43.21 
 
 
326 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.69 
 
 
321 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.76 
 
 
320 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.25 
 
 
323 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.91 
 
 
321 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.33 
 
 
324 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  41.3 
 
 
327 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 
321 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.06 
 
 
321 aa  214  1e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.16 
 
 
322 aa  212  6e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.53 
 
 
321 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.07 
 
 
325 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.43 
 
 
325 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.96 
 
 
314 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  43.9 
 
 
288 aa  202  6e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.7 
 
 
326 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.91 
 
 
326 aa  197  1e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  42.51 
 
 
288 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.79 
 
 
313 aa  184  2e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.57 
 
 
296 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.66 
 
 
383 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  35.84 
 
 
301 aa  145  8e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.22 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.38 
 
 
295 aa  139  5e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.77 
 
 
295 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.07 
 
 
297 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.87 
 
 
299 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.6819e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.65 
 
 
371 aa  135  7e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.61 
 
 
335 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.74 
 
 
299 aa  135  1e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.56 
 
 
336 aa  133  4e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.27 
 
 
366 aa  131  1e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0409  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.41 
 
 
308 aa  131  2e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.927346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.62 
 
 
296 aa  130  2e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.26 
 
 
298 aa  130  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36 
 
 
290 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.95 
 
 
274 aa  129  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.19 
 
 
298 aa  129  8e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.71573e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.85 
 
 
323 aa  127  2e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.79 
 
 
327 aa  127  4e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  2.1867e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.04 
 
 
311 aa  126  4e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.76 
 
 
270 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  1.08216e-08 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.48 
 
 
274 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  33.62 
 
 
272 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  38.89 
 
 
297 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  37.25 
 
 
273 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.22 
 
 
269 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.11 
 
 
269 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.81 
 
 
339 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.3 
 
 
626 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.78 
 
 
272 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.67 
 
 
307 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.7 
 
 
382 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 
272 aa  121  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.7 
 
 
382 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  33.67 
 
 
316 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.15 
 
 
313 aa  120  2e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.48923e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.56 
 
 
296 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.44919e-05  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  38.55 
 
 
269 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
282 aa  119  5e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.05 
 
 
661 aa  119  5e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  31.53 
 
 
280 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 
290 aa  118  1e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  9.86804e-06 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  35.92 
 
 
270 aa  119  1e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.44 
 
 
338 aa  117  2e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.07 
 
 
585 aa  116  4e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 
324 aa  116  4e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  34.31 
 
 
273 aa  116  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  31.78 
 
 
303 aa  115  7e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.62 
 
 
588 aa  115  9e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.68 
 
 
269 aa  115  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  34.87 
 
 
297 aa  115  1e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.97 
 
 
342 aa  114  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.22 
 
 
293 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.5 
 
 
270 aa  113  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.23 
 
 
348 aa  113  4e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.24 
 
 
357 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.84 
 
 
291 aa  111  1e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  36.32 
 
 
320 aa  111  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  1.19274e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.41 
 
 
335 aa  110  2e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.16 
 
 
605 aa  111  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.82 
 
 
621 aa  110  2e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.8 
 
 
340 aa  111  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31 
 
 
287 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.39 
 
 
605 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.39 
 
 
605 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  8.52075e-06 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.39 
 
 
598 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  33.64 
 
 
513 aa  108  8e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.26 
 
 
614 aa  108  8e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.33078e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.39 
 
 
598 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.04 
 
 
571 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0322  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.5 
 
 
307 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491128  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>