27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0058 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  94.55 
 
 
110 aa  213  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  60.71 
 
 
116 aa  145  2e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  57.66 
 
 
114 aa  145  2e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  46.46 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  45.45 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  44.83 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  44.09 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  44.44 
 
 
130 aa  82  3e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  42 
 
 
115 aa  78.6  3e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  38.38 
 
 
122 aa  77  7e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  39 
 
 
115 aa  73.9  7e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  42.22 
 
 
128 aa  72.8  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  43.33 
 
 
137 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  36.63 
 
 
112 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  37.65 
 
 
112 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  42.22 
 
 
138 aa  65.9  2e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  43.75 
 
 
107 aa  63.5  9e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  40.85 
 
 
106 aa  62.8  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  36.84 
 
 
122 aa  60.8  6e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  35.79 
 
 
122 aa  59.7  1e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  35.79 
 
 
122 aa  59.7  1e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1372  hypothetical protein  37.31 
 
 
83 aa  58.2  4e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  46.15 
 
 
130 aa  52.8  2e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  30.95 
 
 
95 aa  50.8  6e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  38.03 
 
 
108 aa  47.8  6e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  29.29 
 
 
121 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>