More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0052 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
167 aa  337  6e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  94.61 
 
 
167 aa  320  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  70.12 
 
 
165 aa  234  5e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  67.83 
 
 
163 aa  194  4e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  49.01 
 
 
160 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
160 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
160 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 
160 aa  137  8e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1375  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 
165 aa  121  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.15 
 
 
176 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 
163 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
165 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
164 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
154 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
164 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
166 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
164 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
164 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  39.47 
 
 
164 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  39.47 
 
 
164 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 
169 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
166 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
166 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 
164 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
166 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
166 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
166 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 
174 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
169 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
169 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
169 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 
165 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
178 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
174 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.54 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
169 aa  97.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
165 aa  97.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
170 aa  97.1  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
170 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.36 
 
 
170 aa  94  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.76 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  35.95 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36.47 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
182 aa  90.5  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
166 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  6.40597e-09 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.65 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.63425e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  35.86 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.59 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 
153 aa  89  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  4.08677e-06 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  32.75 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 
166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.11 
 
 
158 aa  87.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.03329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  37.43 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  37.43 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>