More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0051 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0036  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  91.45 
 
 
759 aa  1320  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.488776  normal  0.166978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  100 
 
 
760 aa  1522  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.45 
 
 
739 aa  606  1e-172  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  3.12859e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0417  two component sensor kinase/response regulator hybrid  48.85 
 
 
544 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
744 aa  328  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
745 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
757 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
752 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
649 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
636 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  34.68 
 
 
647 aa  266  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
744 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
754 aa  263  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
708 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
713 aa  255  2e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
700 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  33.84 
 
 
650 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  33.85 
 
 
693 aa  247  7e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
686 aa  246  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1255 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1267 aa  230  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
929 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  31.05 
 
 
676 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  35.92 
 
 
531 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
676 aa  226  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.24 
 
 
925 aa  224  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3018  histidine kinase  32.4 
 
 
657 aa  224  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  31.53 
 
 
925 aa  221  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1326 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  29.91 
 
 
765 aa  216  1e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.51 
 
 
1135 aa  216  2e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
1064 aa  214  3e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  31.04 
 
 
1214 aa  214  4e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.26 
 
 
852 aa  214  5e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
916 aa  214  5e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  31.11 
 
 
1407 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
1363 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
833 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1165 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
946 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1550 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
1436 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.56 
 
 
1442 aa  208  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.09 
 
 
2213 aa  208  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-07 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4509  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1022 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0775662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1193 aa  207  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
816 aa  207  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1069 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  31.75 
 
 
914 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.6 
 
 
1765 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
1202 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  31.01 
 
 
1287 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
721 aa  206  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
981 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  29.04 
 
 
1322 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  30.6 
 
 
918 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  30.77 
 
 
917 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  30.67 
 
 
905 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
1303 aa  204  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1397 aa  204  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.16 
 
 
917 aa  203  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
997 aa  203  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
957 aa  202  1e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1398 aa  203  1e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
920 aa  203  1e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
922 aa  203  1e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1390 aa  203  1e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
770 aa  202  1e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
866 aa  202  2e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  31.3 
 
 
977 aa  202  2e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
1611 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
916 aa  202  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1622 aa  201  4e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
1369 aa  201  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.59 
 
 
1499 aa  200  8e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
921 aa  200  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
1768 aa  200  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1767 aa  199  1e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  32.22 
 
 
850 aa  199  1e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
914 aa  199  1e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
927 aa  199  1e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1767 aa  199  1e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  28.7 
 
 
1683 aa  199  2e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 
1659 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.25 
 
 
918 aa  198  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
830 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1287 aa  197  4e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  29.9 
 
 
935 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  29.7 
 
 
942 aa  197  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1245 aa  197  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  30.2 
 
 
918 aa  197  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
925 aa  197  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
876 aa  197  8e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1310 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
936 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1166 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  32.85 
 
 
994 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
1436 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
956 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1016 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>