More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0047 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  60.97 
 
 		 921 aa  998    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  55.8 
 
 		 919 aa  902    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  61.89 
 
 		 914 aa  1152    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 908 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 820 aa  702    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  72.03 
 
 		 898 aa  1292    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  71.91 
 
 		 910 aa  1291    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  59.56 
 
 		 910 aa  1026    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  53.05 
 
 		 904 aa  845    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 		 868 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  58.16 
 
 		 905 aa  899    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  57.5 
 
 		 877 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  61.4 
 
 		 907 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 804 aa  721    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  61.15 
 
 		 888 aa  1023    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  95.57 
 
 		 880 aa  1659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  57.79 
 
 		 875 aa  900    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  80.59 
 
 		 915 aa  1422    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  57.48 
 
 		 876 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  57.43 
 
 		 878 aa  911    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 872 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  59.19 
 
 		 962 aa  927    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  60.11 
 
 		 929 aa  923    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.62 
 
 		 929 aa  913    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 872 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  60.83 
 
 		 911 aa  1024    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  49.04 
 
 		 858 aa  740    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 815 aa  636    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 		 804 aa  716    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  54.97 
 
 		 877 aa  875    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  60.85 
 
 		 882 aa  1041    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  57.79 
 
 		 880 aa  899    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  71.91 
 
 		 910 aa  1296    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 908 aa  1825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  60.35 
 
 		 923 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  61.28 
 
 		 907 aa  1043    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  49.55 
 
 		 904 aa  725    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  57.42 
 
 		 879 aa  950    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  48.69 
 
 		 864 aa  715    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  59.17 
 
 		 916 aa  955    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  48.66 
 
 		 873 aa  670    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  72.44 
 
 		 881 aa  1248    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  57.77 
 
 		 925 aa  892    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  59.23 
 
 		 896 aa  952    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  59.62 
 
 		 916 aa  957    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.06 
 
 		 897 aa  824    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  79.48 
 
 		 883 aa  1409    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  45.55 
 
 		 882 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 882 aa  626  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 		 871 aa  622  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 869 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 		 891 aa  614  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 872 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.49 
 
 		 859 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 		 869 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 870 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 900 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 932 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  43.62 
 
 		 855 aa  602  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 873 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 870 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 		 880 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 		 870 aa  594  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  44.44 
 
 		 882 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.28 
 
 		 853 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 892 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 		 882 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 889 aa  592  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 855 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 		 862 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.49 
 
 		 868 aa  586  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 882 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  44.44 
 
 		 882 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 855 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 		 853 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 857 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 858 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 		 868 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 857 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 856 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.65 
 
 		 887 aa  579  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 881 aa  581  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 		 855 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 872 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 851 aa  578  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 887 aa  579  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 861 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 881 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 861 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 859 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 860 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 823 aa  572  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 861 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.38 
 
 		 856 aa  575  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 855 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>