249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0045 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  41.57 
 
 
943 aa  715  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  53.87 
 
 
935 aa  953  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  52.45 
 
 
936 aa  930  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  51.23 
 
 
953 aa  910  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  55.1 
 
 
931 aa  991  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  55.29 
 
 
931 aa  1018  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  64.16 
 
 
912 aa  1113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  40.2 
 
 
930 aa  667  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  61.28 
 
 
934 aa  1171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  73.85 
 
 
949 aa  1418  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  4.04003e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  47.6 
 
 
936 aa  798  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  55.54 
 
 
969 aa  1000  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  51.82 
 
 
931 aa  941  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  54.31 
 
 
928 aa  962  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  40.76 
 
 
914 aa  669  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  43.81 
 
 
912 aa  724  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  55.3 
 
 
932 aa  968  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  62.65 
 
 
934 aa  1192  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  53.11 
 
 
933 aa  982  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  54.42 
 
 
928 aa  965  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  42.11 
 
 
893 aa  686  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  55.74 
 
 
925 aa  977  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 
936 aa  696  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  45.9 
 
 
941 aa  724  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  71.97 
 
 
941 aa  1392  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  40.2 
 
 
930 aa  667  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  40.41 
 
 
930 aa  681  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  52.92 
 
 
1029 aa  928  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  54.21 
 
 
928 aa  960  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  54.17 
 
 
937 aa  931  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  95.97 
 
 
968 aa  1864  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  55.79 
 
 
933 aa  1000  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  100 
 
 
968 aa  1989  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  44.17 
 
 
935 aa  738  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  56.61 
 
 
931 aa  1017  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  61.39 
 
 
934 aa  1174  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  40.97 
 
 
938 aa  629  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.12 
 
 
936 aa  578  1e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  38.51 
 
 
989 aa  558  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.08 
 
 
924 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  32.77 
 
 
902 aa  453  1e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  34.48 
 
 
900 aa  448  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  32.33 
 
 
899 aa  447  1e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.9 
 
 
894 aa  445  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  35.09 
 
 
900 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  34.48 
 
 
900 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.11 
 
 
894 aa  442  1e-122  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  34.36 
 
 
900 aa  442  1e-122  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.21 
 
 
899 aa  441  1e-122  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  33.8 
 
 
900 aa  442  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 
900 aa  442  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.9 
 
 
899 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  33.01 
 
 
906 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  31.38 
 
 
900 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  33.41 
 
 
899 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.64 
 
 
900 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
898 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.52 
 
 
893 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  33.79 
 
 
900 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  33.13 
 
 
857 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.4 
 
 
930 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 
859 aa  418  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  34.06 
 
 
862 aa  419  1e-115  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
930 aa  418  1e-115  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  34.06 
 
 
862 aa  417  1e-115  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.29 
 
 
930 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  34.83 
 
 
887 aa  415  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.54 
 
 
894 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  33.61 
 
 
898 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  33.66 
 
 
859 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  31.81 
 
 
892 aa  413  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  32.4 
 
 
856 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  33.89 
 
 
890 aa  412  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.31 
 
 
905 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  32.93 
 
 
892 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  33.83 
 
 
904 aa  407  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.78 
 
 
864 aa  409  1e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 
861 aa  409  1e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  33.7 
 
 
903 aa  407  1e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  33.46 
 
 
858 aa  407  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  32.76 
 
 
869 aa  409  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 
890 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  32.46 
 
 
859 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 
890 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  33.22 
 
 
912 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  33.22 
 
 
893 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
927 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  33.22 
 
 
893 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  33.58 
 
 
890 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.45 
 
 
890 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  32.84 
 
 
877 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  33.05 
 
 
893 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  33.21 
 
 
890 aa  400  1e-110  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  32.52 
 
 
858 aa  403  1e-110  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  33.83 
 
 
858 aa  401  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 
890 aa  403  1e-110  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 
890 aa  402  1e-110  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  33.66 
 
 
858 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 
890 aa  401  1e-110  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
858 aa  402  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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