More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0041 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
206 aa  416  1e-115  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
202 aa  82.4  4e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  31.55 
 
 
212 aa  73.2  2e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
203 aa  73.2  3e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 
194 aa  66.2  3e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
247 aa  59.7  3e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
247 aa  59.7  3e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
178 aa  59.3  4e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 
202 aa  59.3  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
244 aa  58.5  7e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
204 aa  57.8  1e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
241 aa  57.4  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
204 aa  56.6  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
195 aa  57.4  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
205 aa  57  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.32236e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
231 aa  57  2e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
205 aa  57  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.67757e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
234 aa  57.4  2e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
213 aa  56.2  3e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
221 aa  55.8  4e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
205 aa  55.5  5e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  59.09 
 
 
195 aa  55.8  5e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
204 aa  55.5  6e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 
216 aa  55.5  6e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
273 aa  55.5  6e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 
196 aa  55.1  7e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  28.46 
 
 
190 aa  55.1  7e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 
200 aa  54.7  8e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 
220 aa  54.7  9e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
224 aa  54.7  9e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 
205 aa  54.7  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  54.3  1e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  54.3  1e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
206 aa  54.3  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
212 aa  54.7  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
197 aa  53.5  2e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
193 aa  53.5  2e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2592  regulatory protein TetR  36 
 
 
234 aa  53.5  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28583  normal  0.135199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
206 aa  53.5  2e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
197 aa  53.9  2e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 
210 aa  53.5  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
210 aa  53.9  2e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
203 aa  53.5  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.21 
 
 
226 aa  53.9  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 
201 aa  53.5  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
195 aa  53.1  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 
202 aa  53.1  3e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
210 aa  53.1  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
216 aa  52.8  4e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
210 aa  52.8  4e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
218 aa  52.8  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
224 aa  52.8  4e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  2.64507e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
215 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
216 aa  52.8  4e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
216 aa  52.8  4e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
209 aa  52.8  4e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
208 aa  52.8  4e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
212 aa  52.8  4e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  33.02 
 
 
232 aa  52.4  5e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 
191 aa  52.4  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
217 aa  52.4  5e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
255 aa  52  5e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
203 aa  52.4  5e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 
218 aa  52  6e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
266 aa  52  6e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
195 aa  52  6e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  32.03 
 
 
202 aa  52  6e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
233 aa  52  6e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
204 aa  52  7e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  48.94 
 
 
230 aa  52  7e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
202 aa  52  7e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
197 aa  51.6  7e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 
197 aa  52  7e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
207 aa  51.6  8e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.71 
 
 
211 aa  51.6  8e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
208 aa  51.6  8e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
215 aa  51.6  8e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
211 aa  51.6  8e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.71 
 
 
211 aa  51.6  8e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.71 
 
 
211 aa  51.6  8e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
207 aa  51.6  8e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
221 aa  51.6  8e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
211 aa  51.6  8e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  54.35 
 
 
220 aa  51.6  9e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
226 aa  51.6  9e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.71 
 
 
211 aa  51.6  9e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.71 
 
 
211 aa  51.6  9e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
211 aa  51.6  9e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  45.71 
 
 
211 aa  51.6  9e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
243 aa  51.6  9e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  48.08 
 
 
207 aa  51.2  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  55.56 
 
 
233 aa  51.2  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 
209 aa  51.2  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 
219 aa  50.8  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
233 aa  51.2  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
201 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
211 aa  50.8  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>