22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0040 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0040  Peptidase M15A  100 
 
 
142 aa  286  5e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0028  Peptidase M15A  84.51 
 
 
142 aa  247  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  39.39 
 
 
433 aa  74.3  5e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  43.14 
 
 
459 aa  70.5  8e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  37.86 
 
 
347 aa  68.2  4e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  36.89 
 
 
356 aa  65.5  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  40.71 
 
 
421 aa  63.9  6e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  48.05 
 
 
426 aa  60.8  6e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  41.51 
 
 
183 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  43.4 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  45.28 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  44.44 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.01636e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  39.62 
 
 
163 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>