More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0038 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  85.55 
 
 
354 aa  639  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
354 aa  732  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  98.02 
 
 
354 aa  721  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.99 
 
 
354 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  2.06811e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.65 
 
 
355 aa  557  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.52 
 
 
355 aa  538  1e-152  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.52 
 
 
355 aa  538  1e-152  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.24 
 
 
355 aa  538  1e-152  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 
354 aa  492  1e-138  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 
344 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.29 
 
 
356 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  68 
 
 
348 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 
353 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
353 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 
353 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 
347 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 
350 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.54 
 
 
350 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 
347 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 
349 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 
345 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 
335 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 
347 aa  471  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 
347 aa  468  1e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 
344 aa  468  1e-130  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.43 
 
 
350 aa  467  1e-130  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.36 
 
 
342 aa  444  1e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 
332 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
347 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 
345 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.06 
 
 
341 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.97 
 
 
357 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.97 
 
 
357 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
341 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
339 aa  400  1e-110  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
344 aa  400  1e-110  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
331 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 
331 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
339 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 
333 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 
332 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
332 aa  331  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  48.14 
 
 
342 aa  310  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
355 aa  308  6e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
336 aa  305  8e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
336 aa  305  8e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
335 aa  305  1e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
336 aa  303  3e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
337 aa  302  4e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
337 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  7.08237e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
337 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
339 aa  299  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
337 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
332 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
332 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
327 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
332 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
332 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  44.75 
 
 
360 aa  286  3e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
337 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
337 aa  286  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
327 aa  285  6e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
332 aa  285  6e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
335 aa  285  6e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
334 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
332 aa  285  1e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
334 aa  285  1e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
332 aa  284  2e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
332 aa  283  3e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
338 aa  283  3e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
334 aa  282  5e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
338 aa  283  5e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
337 aa  282  8e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
338 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
332 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
334 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
339 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
338 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
365 aa  278  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
328 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
347 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
335 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
334 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  7.59272e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
334 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
346 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
346 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
337 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
346 aa  275  1e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
338 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
333 aa  273  4e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
335 aa  273  4e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
333 aa  272  5e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0167  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
333 aa  272  6e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
332 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
333 aa  272  8e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
334 aa  272  8e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
332 aa  272  8e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
332 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
332 aa  270  3e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
348 aa  270  3e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>