More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0033 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
142 aa  283  6e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  98.59 
 
 
142 aa  280  6e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  90.3 
 
 
135 aa  247  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  74.44 
 
 
168 aa  208  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  72.39 
 
 
149 aa  199  1e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  68.38 
 
 
144 aa  196  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  72.93 
 
 
150 aa  195  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  71.21 
 
 
135 aa  196  1e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  67.16 
 
 
140 aa  195  2e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  73.08 
 
 
151 aa  194  4e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  70.9 
 
 
156 aa  194  5e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  70.15 
 
 
139 aa  193  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  70.9 
 
 
143 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  67.67 
 
 
141 aa  191  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  69.06 
 
 
137 aa  190  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  70.68 
 
 
143 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  69.34 
 
 
165 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  65.15 
 
 
140 aa  184  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 
140 aa  183  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  60.71 
 
 
137 aa  173  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  64.06 
 
 
137 aa  172  1e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  64.84 
 
 
137 aa  171  3e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  64.84 
 
 
137 aa  171  3e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  60.43 
 
 
138 aa  166  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  55.73 
 
 
151 aa  153  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
144 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 
158 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  53.17 
 
 
142 aa  139  1e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  53.6 
 
 
141 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  55.28 
 
 
141 aa  135  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  54.76 
 
 
142 aa  134  3e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  48.48 
 
 
138 aa  134  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  54.47 
 
 
141 aa  132  2e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
150 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  41.48 
 
 
148 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  41.48 
 
 
148 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  41.48 
 
 
148 aa  113  1e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.35806e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
150 aa  109  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.69196e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
150 aa  109  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.38653e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  42.96 
 
 
149 aa  109  1e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
150 aa  109  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.60215e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.77584e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.82448e-07  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
150 aa  109  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  6.79753e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  42.22 
 
 
150 aa  109  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 
148 aa  109  1e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.69107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 
167 aa  108  2e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  42.22 
 
 
167 aa  109  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 
167 aa  108  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  42.96 
 
 
149 aa  109  2e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40.74 
 
 
148 aa  107  4e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.06726e-07  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  41.48 
 
 
148 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.81175e-07  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 
148 aa  107  8e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  40.3 
 
 
153 aa  106  9e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.99535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 
143 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.64453e-12  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 
148 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  38.3 
 
 
143 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.22874e-08  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  41.73 
 
 
154 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  42.15 
 
 
143 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  40.16 
 
 
142 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  42.64 
 
 
140 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 
143 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  37.59 
 
 
143 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  39.68 
 
 
139 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  41.98 
 
 
146 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  42.15 
 
 
176 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  37.59 
 
 
143 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.66153e-09  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  38.24 
 
 
161 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.1646e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  38.89 
 
 
143 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  41.22 
 
 
143 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.2945e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  39.52 
 
 
157 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  39.52 
 
 
157 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  37.5 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.31479e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  37.5 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.55764e-09  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  39.52 
 
 
157 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  39.26 
 
 
147 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  37.5 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.39379e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  38.52 
 
 
143 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  37.78 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  37.5 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.43772e-09  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  41.94 
 
 
143 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  40.5 
 
 
144 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  40.32 
 
 
135 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.1899e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  42.5 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 
150 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
140 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  38.52 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.86155e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  39.67 
 
 
144 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  39.5 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  37.04 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.88037e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  37.04 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.80206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  44.62 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  37.04 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.68341e-06  normal  0.147817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>