More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0030 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  100 
 
 
349 aa  707  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  97.99 
 
 
350 aa  689  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  85.14 
 
 
351 aa  613  1e-174  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33124e-08 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  83.43 
 
 
357 aa  591  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  76.49 
 
 
353 aa  506  1e-142  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  77.46 
 
 
327 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  77.14 
 
 
327 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  69.66 
 
 
348 aa  466  1e-130  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  63.64 
 
 
370 aa  417  1e-115  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  63.38 
 
 
345 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  61.66 
 
 
352 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  61.23 
 
 
351 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  61.35 
 
 
351 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  62.03 
 
 
344 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  59.94 
 
 
342 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  60.68 
 
 
349 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  59.37 
 
 
379 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  59.94 
 
 
338 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  60.44 
 
 
349 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  59.76 
 
 
365 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  59.21 
 
 
368 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  60.38 
 
 
368 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  60.38 
 
 
368 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  59.51 
 
 
369 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  56.92 
 
 
355 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  53.41 
 
 
360 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  55.42 
 
 
335 aa  344  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  54.27 
 
 
341 aa  343  3e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  54.79 
 
 
333 aa  340  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  55.94 
 
 
348 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  52.52 
 
 
373 aa  338  6e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  51.01 
 
 
363 aa  338  1e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  53.31 
 
 
337 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  53.64 
 
 
375 aa  329  5e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  50.6 
 
 
338 aa  326  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  52.63 
 
 
322 aa  325  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  51.06 
 
 
346 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  51.06 
 
 
346 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  51.06 
 
 
339 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  54.63 
 
 
326 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  314  1e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  314  1e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  314  1e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  314  1e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  314  1e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  312  5e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.88335e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  312  5e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  312  6e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  51.59 
 
 
319 aa  310  3e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  52.08 
 
 
319 aa  307  2e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  51.27 
 
 
319 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  51.92 
 
 
326 aa  304  1e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  52.3 
 
 
315 aa  304  1e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  48.92 
 
 
331 aa  303  4e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  47.17 
 
 
328 aa  302  6e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  52.41 
 
 
320 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  48.8 
 
 
335 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  51.44 
 
 
316 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  47.54 
 
 
338 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  48.8 
 
 
335 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  52.43 
 
 
339 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  50.99 
 
 
315 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  50.99 
 
 
315 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  50.92 
 
 
316 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  50.92 
 
 
323 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  49.85 
 
 
364 aa  299  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  48.77 
 
 
329 aa  298  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  48.75 
 
 
323 aa  298  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  48.47 
 
 
325 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  47.26 
 
 
352 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  48.48 
 
 
344 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  51.83 
 
 
359 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  50.16 
 
 
332 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  49.69 
 
 
330 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  49.84 
 
 
332 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  50.16 
 
 
332 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  49.84 
 
 
332 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  49.53 
 
 
319 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  47.55 
 
 
348 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  48.05 
 
 
341 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  48.12 
 
 
354 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.4 
 
 
348 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  48.12 
 
 
354 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.4 
 
 
348 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.4 
 
 
348 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  47.84 
 
 
348 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  48.69 
 
 
352 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  46.13 
 
 
361 aa  294  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  48.69 
 
 
352 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  48.69 
 
 
352 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  49.17 
 
 
348 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  48.69 
 
 
352 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  48.12 
 
 
354 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  51.27 
 
 
319 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  48.99 
 
 
348 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  48.29 
 
 
340 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  48.29 
 
 
340 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  49.09 
 
 
331 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  49.85 
 
 
348 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  51.1 
 
 
343 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>